大數據影像資料庫

Biolucida

 

實現真正的大數據影像Where big image data comes alive

Biolucida是一個用來管理大容量的影像檔軟體,像是二維(XY平面)或三維(XYZ立體)的虛擬切片影像(全切片影像) , 共聚焦顯微鏡疊圖影像 (含有z軸訊息), 高解析度的拼接影像...等

Biolucida目前有三種應用:

使用Biolucida讓您上課的內容更加E化及更豐富 —互動式的管理學習軟體,可以由共同實驗室一同建立學習內容. Biolucida 模擬出像顯微鏡操作的體驗,將影像可以做Z軸的對焦,從最上層到最下層,讓老師們可以將教材傳遞得更遠,內容更加豐富. 數以百計的學生可以同時的使用Biolucida,您可以在人數最多的班級使用Biolucida.

                                                                          

許多老師們使用虛擬的切片—數位化的高解析度組織樣本—取代了顯微鏡,來教授組織學及病理組織學課程內容. 然而,擷取虛擬切片映像的方法有很多種, 如何在課堂上展示給學生就變得很困難並且費時.
Biolucida有一些特別的方法來創造易於溝通的學習環:

  • 指出一個您所感興趣精確的位置給其他使用者觀察 - 使用註解及書籤的功能來圈出特定區域,加上文字敘述,連結到在組織中某一特殊結構...等.
  • 讀取影像的時候不需要等待太長的時間, 人數眾多的班級在考試的時候也不需要交錯時間-  不論您課堂上有10個或是200個學生, 他們都能同時快速的讀取切片影像
  • 學生們可以更容易地討論課堂上的教材 - 整合虛擬切片到一些網路教學平台(如美國 Blackboard, Moodle, or Sakai).
  • 增加新的稀有樣本 - Biolucida支援絕大部分切片掃描機、各式的顯微鏡所得到的虛擬切片影像,您可以用來保存您全部的影像收藏 . 想要擴增您的影像收藏, 您可以透過跟其他老師分享或交換切片,或是使用MBF Bioscience資料庫裡的檔案.

一個有效益且激勵人心的課程,關鍵在於良好的溝通. 老師對於影像內容有完全的控制權,您可以決定如何透過虛擬切片來跟學生溝通基礎概念與想法.

  • 管理學生經驗 - 個別授權- 學生只能看到您所授權給他們的影像, 關閉切片導覽功能, 關閉註解...等.
  • 客製化切片管理 - 使用標籤, 書籤, 或是您的網站來管理授課的教材
  • 整合補充材料 - 增加超連結到特定網站、影像網址...等. 進一步解釋您的切片內容
  • 在各種裝置上觀看您的切片 - Biolucida 可以在PCs, Macs, Apple/ Android 手機上及平板上觀看在資料庫中的所有內容.

 


觀看,管理,發表大影像資料 

Biolucida是您二維及三維影像資料的集中器. 它能讓您安全及永久的在網路中儲存您所有的二維三維影像資料及元數據. 這些影像可以由切片掃描機或顯微鏡系統取得, 影像可以是各種大小、各種不同的倍數顯示 - Biolucida就是為了處理大影像資料而生. Biolucida擁有無限的可能性: 將影像分享給共同研究者, 在您要發表的文章當中加入更大範圍的清晰影像, 開始或者是貢獻您的珍藏大影像資料到影像博物館中, 在任何有網路的電腦上,使用Neurolucida 或 Stereo Investigator進行分析...等. 對於這些影像您擁有絕對的控制權. 

+ 看看如何使用Biolucida來準備影像資料 - 發表在Neuroscience的 Current Protocols當中.

Image storage solved with Biolucida

大影像儲存: 不再是個問題

Biolucida可以永久的儲存您的大影像資料 . Biolucida可以處理非常多不同種類的影像格式, 例如共聚焦顯微影像疊圖
(z軸訊息), 影像蒙太奇拼接, 二維或三維虛擬切片影像 - 不論影像大小, Biolucida都能架設在您實驗室既有的IT設備,或是為您架設一組新的IT設備,抑或是由我們來為您管理您的影像資料.

 

 

 

分析影像

Images stored with 由Biolucida儲存的影像可以使用Neurolucida開啟- 用來分析神經元重構及資料分析,或是使用Stereo Investigator開啟- 用來進行體視學計數分析. 您可以在您的筆記型電腦裡安裝Neurolucida或是 Stereo Investigator,這樣您在任何地方都可以進行資料分析: 在家裡、在圖書館;在您的實驗室或是在咖啡館裡. 如果您的共同研究者擁有 Neurolucida 或 Stereo Investigator, 他/她也可以透過您在Biolucida的分享進行影像資料分析h. 



 

使用Biolucida, 科學期刊能發表完整高解析度的二維或三維的影像資料組合. 有多種不同的影像資料呈現方式,包含整個器官的全切片連續影像(虛擬切片),  CLARITY, iDISCO或其他透化結構的方法做出的三維組織透化影像, 三維重構全切片影像, 高解析影像蒙太奇拼接, 還有更多. Biolucida能讀取絕大部分格式的顯維影像,還有切片掃描器廠商做出的影像格式. 影像資料透過Amazon Web Services能夠安全的被管理, 或者我們可以將Biolucida整合到您實驗室中的IT設備當中. 

 

即刻讀取巨大的影像資料庫

Biolucida可以非常快速的呈現/開啟二維和三維的影像. 不使用Java或是Flash(容易成為網路安全漏洞),確保在最安全的環境底下讀取您的影像資料

 

 

 

 

Image storage solved with Biolucida

沒有限制的儲存容量

大影像資料庫可以佔據非常大的儲存空間,我們可以幫您解決! 使用Amazon Web Services,在最安全的環境底下, 期刊可以選擇沒有限制的網路空間,您再也不用擔心儲存空間不夠的問題.

 

 

 

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